RSIA Cahaya Sangatta memiliki 6 kelas instalasi rawat inap yang terdiri dari 41 kamar. Fasilitas instalasi rawat inap tersebut adalah Ruang Kelas 3, Kelas 2, Kelas 1, Paviliun, VIP, dan VVIP, fasilitas tersebut telah memiliki akreditasi bintang 5 paripurna.
